蓝泽耕作（山下智久 饰）离开了翔阳大学附属北部医院的急救中心，成为了一名神经外科医生。白石惠（新垣结衣 饰）依然在人手不足的急救中心担当着领导者的角色。曾经也梦想成为飞行急救医生的绯山美帆子（户田惠梨香 饰）离开翔阳医院，成为了妇产科医生。冴岛遥（比嘉爱未 饰）依然从事着飞行急救护士的工作。藤川一男

炎炎夏季，金田一（山田凉介 饰）和七濑美雪（川口春奈 饰）、佐木龙二（有冈大贵 饰）两名好友前往著名的狱门补习学校参加集中培训。当他们正聊天玩笑时，突然警铃声大作。校舍走廊内，名为茂吕井的学生手按在警铃上，惨遭毒害。经金田一缜密推理，确定这是一起有针对性和计划性的杀人事件。未过多久，他们重逢香港警员

为纪念《CodeBlue》剧场版7月27日上映，富士台将在7月28日播放Code Blue特别篇《Code Blue特别篇 另一个战场》，同时在23~27日晚0:25分播出五夜连续的衍生剧《Code Blue -另一个日常-》。