三年前的那场事故 使得凉宫遥以及鸣海孝之的人生发生了巨大的变化。

天河优人（平川大辅 配音）是个独自生活孤苦伶仃的内向少年，对于生活，优人只希望能够平平安安的度过余生就好。可是事与愿违，在其16岁生日的那一天，一个名叫野井原绯鞠（小清水亚美 配音）的黑发女孩子出现在了他的面前，同时，亦有形状可怖的怪物对优人发起了攻击。